Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms