Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr29B1ARI9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms