Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprsB0V2N1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms