Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M5A7VMS3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms