Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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