Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b5A3FIN4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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