Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf39A2RT81 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms