Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtf1A2AQ19 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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