Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms