Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc183A2AJB1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc183A2AJB1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc183A2AJB1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc183A2AJB1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc183A2AJB1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc183A2AJB1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms