Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13941A2AJ38 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms