Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm16A2A935 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm16A2A935 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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Prdm16A2A935 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Prdm16A2A935 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm16A2A935 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Prdm16A2A935 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Prdm16A2A935 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Prdm16A2A935 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Prdm16A2A935 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Prdm16A2A935 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm16A2A935 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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