Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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