Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl27Q9Z1X0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms