Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms