Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms