Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sumo3Q9Z172 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms