Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms