Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnip1Q9WUU8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnip1Q9WUU8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms