Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Wdr54Q9R0D8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Wdr54Q9R0D8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms