Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms