Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms