Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ripk3Q9QZL0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk3Q9QZL0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms