Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms