Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Tnnt3Q9QZ47 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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