Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Phtf1Q9QZ09 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Phtf1Q9QZ09 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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