Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VapbQ9QY76 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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VapbQ9QY76 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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