Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nr2e3Q9QXZ7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nr2e3Q9QXZ7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr2e3Q9QXZ7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nr2e3Q9QXZ7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nr2e3Q9QXZ7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nr2e3Q9QXZ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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