Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChmQ9QXG2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms