Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms