Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dclk1Q9JLM8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dclk1Q9JLM8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms