Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms