Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms