Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms