Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms