Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
OtofQ9ESF1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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