Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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