Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tspan4Q9DCK3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan4Q9DCK3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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