Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmg20aQ9DC33 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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