Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrpraQ9DBG7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms