Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chmp2aQ9DB34 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms