Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf4Q9DAW6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf4Q9DAW6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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