Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms