Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms