Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms