Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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