Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms