Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snx5Q9D8U8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snx5Q9D8U8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snx5Q9D8U8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Snx5Q9D8U8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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