Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms