Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Borcs6Q9D6W8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Borcs6Q9D6W8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Borcs6Q9D6W8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Borcs6Q9D6W8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms